Home > Mutations

Untitled Document

The mutations reported from Antithrombin are listed below:

Click on the highlighted residues for further information on mutation.


MYSNVIGTVTSGKRKVYLLSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEK
KATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFA
MTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFG
DKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAIN
ELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQ
VLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDG
FSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAV
VIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK

Missense

Position* Wild type Mutant Domain PMID
39IleAsn 3169232
48ProHis 15733967
56ArgCys 2365065
64MetThr 12894857
73ProLeu 3080419, 2794060
79ArgCys 6582486, 3960724, 3605071, 11279641, 7981186
79ArgHis 3567355, 2349545, 2363123
79ArgSer 3350974
81TrpLys 16128566
91AlaVal 17492649
109PheLeu 12939144
112ProSer 15140129
112ProThr 7959685
121MetLys 12894857
127CysArg 12399451, 9157604
130ThrIle 16411389
131LeuPhe 1555650, 15946526
131LeuVal 7734360
146LysAsn 10766996
146LysGlu 12353073
148SerPro 8443391, 16575261, 17492649
150GlnPro 11192751, 7734360
151IlePhe 16705712
152HisTyr 7959685
160CysTyr 7981186
161ArgGlu 2229057
167AsnThr 10361121
178LeuHis 12894857
179PheLeu 15164384, 16705712
214SerPhe 10997988
219AsnAsp 7989582, 7795154, 15630491
219AsnLys 15630491
223SerPro 10997988
226ThrIle 11154130
243ThrIle 10997988
251IleThr 10997988
261PheLeu 12595305
269GluLys  
273LysGlu 20435622
283MetIle 7959685
283MetVal 10997988
305ProLeu 16705712
316IleAsn  
317LeuSer 16705712
318ProLeu 16705712
334GluLys  
352MetArg 15338392
397SerPro 10997988
398AspHis 16908819
401HisTyr 16705712
403AlaPro 16705712
408AsnLys 11192751
414AlaThr 3179438, 2029579, 7734359
416AlaPro 2794060, 2776881, 1998601
416AlaSer 1906811, 19277409
424GlyAsp 1547341
425ArgPro 2722864, 2013315
426SerLeu 3805013, 2602168, 8401542
434PheCys 1469094
434PheLys 1469094, 7863481
434PheSer 1469094
437AsnLys 1469094
438ArgGly  
438ArgMet 1776135
439ProAla 16705712
439ProLeu 3191114
439ProThr 18480576, 1469094
440PheSer 16705712
441LeuPro 16705712, 12894857
456GlyArg 15140129
456GlyCys 8274732
457ArgThr  
461ProLeu 1536946

Insertion

Mutation Codon Exon/Intron Domain PMID
 5501insA        7994035
 insACCG  387      7878627
 13199-13200insC    Exon 6    15164384
 13316-13317insG    Exon 6    15164384
 2463delGinsTC        7994035
 2606insT        1325679
 2770insT        1325679
 5501insA        7994035
 6523-6524insA        1325679
 7392-7394insA        1932746
 13277insACCG        7878627
 13342insA        1873224, 7981186
 13379insA        8217824
 13387-89insG        1873223
 13412-4insA         1873223
 10-bp insertion    Exon 6    19760264
 7429-30insT        16839598
 9761-9762insT        16705712
 7916-7917insT    Exon 4    16000134
 2420or2424insCTTT    Exon 2    12474289

Deletion

Mutation Codon Exon/Intron Domain PMID
 106-108delAT        8486379
 9 bp deletion    Exon 6    7981186
 7671delG        7994035
 7768-7769delG        7994035
 deletion of 105 bp    Exon 4    7878627
 delAA  412-413  Exon 6    7878627
 5333delG    Exon 3a    10997988
 5349-5353delAGATC    Exon 3a    10997988
 5354-5362delCACTTC    Exon 3a    11794707
 2581-2584delTATC    Exon 2    15164384
 2599-600delC        8735803
 2610-31del22bp insA        8217824
 2627-29delAAT        8217824
 2690-95delATTTTC        8735803
 2705-6delCT        8217824
 2706delT        1873223
 5311-5320del6bp        8486379, 8401542
 5352delT        1979501
 5356-64delCTT        8217824, 8401542, 15309521
 5448-50delC        7949130
 6457-59delATC        7949130
 7445delA        1868237
 7443-46delAG        1868237
 7580-83delAG        1932746
 7596delA or delG        8217824
 7634-39del4bp        1932746
 7644-49delGGA        8217824
 7671delG        7994035
 7768-69delG        7994035
 9852-9853delA        1325679
 13347-13351delT        8217824
 13354delAA        7878627
 13354delAAGAG        8401542
 13397-405del9bp        7981186
 2,769-bp deletion    Exon 6    19760264
 1,892-bp deletion    Exon 6    19760264
 2417delT        17492649
 5519-5521del        16705712
 2593del    Exon 2    16705712
 9738del        16705712
 2771-2773delATG        15935830
 13387-13389delG        15741804
 13,260-13,262 del        15733967
 13389delG    Exon 6    12482344
 5386-5387delCT        11192751
 13246-13248delTGA        11192751
 1,442 bp del and ins GAGACG        10823268

Nonsense

Mutation* Codon Exon/Intron Domain PMID
 Cys53X        
 Glu145X    Exon 3A    10766996
 Cys160X        16705712
 Arg161X        7994035
 Arg161X        1873224
 Arg164X        7578894, 12894857
 Leu172X        1360174
 Gln191X        12894857
 Glu195X        11192751
 Arg229X        1360174, 11192751
 Gln271X        1360174, 11192751
 Glu272X    Exon 4    16000134
 Glu338X    Exon 4    11794707
 Arg391X        12894857, 16154182
 Tyr395X    Exon 5    17278425
 Ser397X        11307839

Splice site

Mutation Codon Exon/Intron Domain PMID
 IVS4-G>A    Exon 5    7981186
 2463 G>TC        7994035
 IVS2-1G>T    Intron 4    15164384
 IVS4-14G>A    Intron 2    15164384
 G2777C        11192751

* The positions are based on the protein sequence inclusive of the signal peptide if present.


Useful Links

©Biomedical Informatics Centre, NIRRH, Mumbai